Кобаламин: координация, которая работает

Четыре атома азота коррина координируются с кобальтом в плоскости кольца. Две оставшиеся позиции расположены по разные стороны этой плоскости и называются аксиальными. При обсуждении степеней окисления помни: обозначение Co(III) относится к состоянию кобальта, но в ферментативном цикле кобальт может переходить и в другие состояния.

Не нужно воспроизводить полную структурную формулу с боковыми заместителями. Важно запомнить геометрию коррина и его отличие от порфирина: одна пара соседних пятичленных колец соединена напрямую. Это создаёт характерную координационную среду кобальта.

DMB — 5,6-диметилбензимидазол, часть нуклеотидной петли кобаламина. Когда он координирован с кобальтом, описывают конформацию base-on; если эта связь отсутствует — base-off. Здесь достаточно увидеть, что нижний аксиальный лиганд связан с частью молекулы, а не обязательно является свободной внешней группой.

В общей схеме оставь DMB на нижней стороне комплекса и сравни только верхние лиганды. CN⁻ характерен для цианокобаламина, CH₃ — для метилкобаламина, а 5′-дезоксиаденозильный остаток — для аденозилкобаламина. Для аква- и гидроксоформ верхняя позиция занята водой или гидроксильной группой в зависимости от условий.

Разграничь форму хранения и коферментную функцию. Цианокобаламин стабилен и широко известен как форма витамина, но в клетке он должен быть преобразован. Метил- и аденозилкобаламин — коферментные формы для разных реакций. Не утверждай, что сам факт наличия CN⁻ непосредственно объясняет каталитическую активность двух ферментов.